《雪迷宫》的剧情围绕着 1997 年东北哈岚市的禁毒故事展开。在虚构的哈岚市，一种名为冰毒的新型毒品悄然出现。当地警方在调查玻璃厂的一起命案时，发现这起案件涉及毒品交易。刑警队长郑北（黄景瑜饰）发现嫌疑人是来自南方的毒贩，其在交易时与受害者发生冲突并杀人后潜逃。

为了集中警力铲除罪恶，哈岚市局专门成立了禁毒专案组，由郑北担任队长。他们首先将盘踞在城市中的摇头丸贩毒团伙一举歼灭，随后顺藤摸瓜，调查出隐藏其后的冰毒犯罪集团，掌握了贩毒团伙的犯罪证据，摸清了从制毒、运毒到销售的整个犯罪链条。

在这个过程中，来自粤东花州的毒品专家顾一燃（王子奇饰）发挥了重要作用。然而，顾一燃有着自己的心事，他的父亲被毒贩杀害，他一直想要找出真凶为父报仇。随着剧情的发展，顾一燃越发确定秦义背后的人就是他的杀父仇人。